Павел,
по моему опыту проведения транспортных тендеров, компании, предлагающие собственный автопарк, стоят дороже чем экспедиторы, привлекающие частников.

Думаю что секрет в модели бизнеса: водитель, заработавший своим трудом на 2-5 машин, более эффективный собственник нежели крупное автопредприятие. 

Это подтверждает и общение с западными экспедиторами. С их слов, в Европе преобладают частники с несколькими машинами.

Михаил,

судя по вопросу «оптимизируй и сократи затраты», начать нужно с анализа затрат. Попробуйте перевести участки склада в деньги (человекочасы). Обратите также внимание на стоимость здания, электричества, техники, .. Отсортировав по затратам, поймете с чего начать.